发布: 更新时间:2023-03-26 10:18:34
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IP是网络之间互连的协议,与医学没有任何关系;
IP是TCP/IP体系中的网络层协议。设计IP的目的是提高网络的可扩展性:一是解决互联网问题,实现大规模、异构网络的互联互通;
二是分割顶层网络应用和底层网络技术之间的耦合关系,以利于两者的独立发展。根据端到端的设计原则,IP只为主机提供一种无连接、不可靠的、尽力而为的数据报传输服务。
扩展资料:
IP位于TCP/IP模型的网络层(相当于OSI模型的网络层),对上可载送传输层各种协议的信息,例如TCP、UDP等;对下可将IP信息包放到链路层,通过以太网、令牌环网络等各种技术来传送。[2]
为了能适应异构网络,IP强调适应性、简洁性和可操作性,并在可靠性做了一定的牺牲。IP不保证分组的交付时限和可靠性,所传送分组有可能出现丢失、重复、延迟或乱序等问题。
一个IP分组由首部和数据两部分组成。首部的前20字节是所有IP分组必须具有的,也称固定首部。在首部固定部分的后面是一些可选字段,其长度是可变的。
IP:immunoprecipitation 免疫沉淀(纯化目的蛋白)
IB:immunoblotting 免疫印迹,即Western Blotting(显示目的蛋白)
HA:带有HA标签的蛋白(抗HA抗体来显示目的蛋白)
Input:阳性对照,就是用IP之前的裂解液做IB(排除假阳性干扰)
这个实验结果说明:Pi13蛋白与AtCaM蛋白之间存在相互作用。
不懂,请追问。。。希望可以帮到你。祝您顺利毕业!
文献信息:
Abe, T., et al. (2017). "Germ-Cell-Specific Inflammasome Component NLRP14 Negatively Regulates Cytosolic Nucleic Acid Sensing to Promote Fertilization." Immunity 46 (4): 621-634.
先看一下图中的缩写:
IP全称是immunoprecipitation,即免疫沉淀,这一步主要是为了纯化目的蛋白。
IB全称是immunoblotting,即免疫印迹,也就是常规的Western Blotting,用于显示目的蛋白。
WCL全称是whole cell lysates,即整个细胞的裂解成分。
HC全称是heavy chain,即重链,
LC全称是light chain,即轻链。
将图分为三部分,先看第一部分,即上面的部分,“+”表示含有这种蛋白,“-”表示没有,这个实验一共做了四组,从左到右分别为:①只表达HA-cGAS的293T细胞;②共同表达HA-cGAS与NRLP14-FL的293T细胞;③只表达STING-HA的293T细胞;④共同表达STING-HA与与NRLP14-FL的293T细胞,如下所示:
再看第二部分WB的图,WB的图就是使用含有FLAG抗体的珠子拉下来的蛋白做的,使用拉下来的这些蛋白再做WB,它的原理前面已经描述过了。使用FLAG抗体的珠子拉下来的蛋白使用HA抗体来进行检测,其结果如下:
从上面的图像可以看出以下信息:
第一, HC与LC条带都非常明显,之所以出现这个条件是因为,在WB之前进行的蛋白变性这一步,由于加样缓冲液中含有巯基乙醇,巯基乙醇会把抗体的重链和轻链之间的二硫键破坏,从而使的抗体变成重链分子55KD和轻链分子25KD,因此会在结果中呈现两个条带。
第二, 第一组(只表达HA-cGAS的293T细胞)中没有条带,第二组(共同表达HA-cGAS与NRLP14-FL的293T细胞)没有条带,第三组(只表达STING-HA的293T细胞)有一点点条带,第四组(共同表达STING-HA与与NRLP14-FL的293T细胞)条带明显,这说明NLRP14与STING有相互作用,为什么说有相互作用呢?因为我们是用FLAG抗体来拉的蛋白,从理论上讲,我们只能拉下FLAG标记的NLRP14,也就是NLRP14-FL(FL就是FLAG),但是,从拉下的蛋白中用HA进行检测,居然检测出来了HA标记的STING,这就说明,使用FLAG拉NLRP14-FL时,这个蛋白复合物中含有STING-HA。
再看图的第三部分,也就是下面的这一部分,是用FLAG抗体和HA抗体来进行检测整个细胞的裂解液,是作为阳性对照(有的文献中会标明input组),如下所示:
其中右侧的WCL表示的是整个细胞的裂解液,也就是还没有使用FLAG抗体的珠子去拉的时候的样本,也就是说直接裂解了293T细胞后的样本,从这个结果中可以得到以下信息:
第一, 在使用FLAG抗体进行检测全蛋白时,相当于阳性对照。第一组(只表达HA-cGAS的293T细胞)中没有条带,因为这种293T细胞中只有HA标记的cGAS,第二组(共同表达HA-cGAS与NLRP14-FL的293T细胞)有条带,因为FLAG抗体能检测出使用了FLAG标记的NLRP14,NLRP14的蛋白分子量大概是125kD,第三组(只表达STING-HA的293T细胞)没有条带,因此这种293T细胞只表达HA标记的STING;第四组(共同表达STING-HA与与NLRP14-FL的293T细胞)条带明显,因为这个细胞中含有FLAG标记的NLRP14。
第二, 使用HA抗体检测全蛋白,这是阳性对照,是说明细胞中含有相应的蛋白。我们可以发现,第一组(只表达HA-cGAS的293T细胞)在27kD附近没有条件,在50kD部分有条带,这说明,全蛋白中含有HA标记的cGAS(cGAS的蛋白分子量是62kD,多数蛋白标签的分子量很少,基本可以忽略),做这个实验主要是作为阳性对照;第二组(共同表达HA-cGAS与NLRP14-FL的293T细胞)在37kD附近没有条带,在50kD附近有条带;结合前面的结果来看,就说明这个细胞中含有HA标记的cGAS(因为它的分子量大概是50kD),还含有FALG标记的NLRP14(因为NLRP14的蛋白分子量大概是125kD);第三组(只表达STING-HA的293T细胞)在37kD处有条带,这说明细胞中含有HA标记的STING(因为STING的分子量大概是35kD);第四组(共同表达STING-HA与与NLRP14-FL的293T细胞)在110kD处有条带,在37kD处也有条带,这说明这种细胞中含有NLRP14与STING。
从上面的图片可以知道,在做Co-IP实验时。需要设立阳性对照组来证明你的细胞中有某个蛋白A与B,再使用抗蛋白A的抗体来拉A蛋白,再使用抗蛋白B的抗体来检测拉下来的蛋白,如果检测到了蛋白B,就说明蛋白A与蛋白B有相互作用。
IP(免疫共沉淀)和input(输入)是两种常见的蛋白检测方法,各有优缺点,应根据实际需要进行选择。
IP方法是通过特异性抗体与目标蛋白结合,将目标蛋白从样品中共沉淀下来,然后进行分析。这种方法可以选择性地富集目标蛋白,因此对于目标蛋白含量低、存在于复杂样品中的情况,具有很好的检测效果。但是,IP方法需要有特异性抗体,且操作流程比较繁琐,需要较长的时间。
而input方法则是直接将样品分析,不需要进行富集。这种方法操作简单、快速,但对于目标蛋白含量低、存在于复杂样品中的情况下,检测灵敏度和特异性可能不如IP方法。
因此,如果目标蛋白含量较低、存在于复杂样品中,或需要进行定量分析时,可选择IP方法;如果目标蛋白含量较高、样品较简单,或需要快速检测时,可选择input方法。
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